Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC38Q502W7 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms