Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSPP1Q1MSJ5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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