Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIP4Q15650 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIP4Q15650 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms