Protein–RNA interactions for Protein: Q15527

SURF2, Surfeit locus protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF2Q15527 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SURF2Q15527 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms