Protein–RNA interactions for Protein: Q15119

PDK2, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK2Q15119 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK2Q15119 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK2Q15119 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK2Q15119 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK2Q15119 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK2Q15119 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK2Q15119 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK2Q15119 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK2Q15119 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK2Q15119 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK2Q15119 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK2Q15119 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK2Q15119 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK2Q15119 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK2Q15119 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK2Q15119 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK2Q15119 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK2Q15119 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK2Q15119 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK2Q15119 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK2Q15119 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms