Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PCOLCEQ15113 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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