Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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NR1D2Q14995 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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NR1D2Q14995 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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NR1D2Q14995 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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NR1D2Q14995 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1D2Q14995 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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