Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNB1Q14721 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNB1Q14721 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNB1Q14721 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNB1Q14721 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNB1Q14721 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNB1Q14721 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNB1Q14721 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNB1Q14721 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNB1Q14721 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNB1Q14721 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNB1Q14721 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
KCNB1Q14721 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
KCNB1Q14721 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
KCNB1Q14721 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
KCNB1Q14721 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNB1Q14721 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms