Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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SEMA3AQ14563 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
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SEMA3AQ14563 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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SEMA3AQ14563 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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SEMA3AQ14563 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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