Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBX1Q14549 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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GBX1Q14549 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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GBX1Q14549 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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GBX1Q14549 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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GBX1Q14549 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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GBX1Q14549 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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GBX1Q14549 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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GBX1Q14549 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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GBX1Q14549 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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