Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms