Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM29Q14134 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM29Q14134 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM29Q14134 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM29Q14134 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM29Q14134 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM29Q14134 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM29Q14134 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM29Q14134 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM29Q14134 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM29Q14134 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM29Q14134 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM29Q14134 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM29Q14134 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM29Q14134 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM29Q14134 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM29Q14134 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM29Q14134 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM29Q14134 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM29Q14134 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM29Q14134 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM29Q14134 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM29Q14134 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM29Q14134 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM29Q14134 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM29Q14134 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM29Q14134 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM29Q14134 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM29Q14134 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
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