Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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