Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CUL1Q13616 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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