Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
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ITGB3BPQ13352 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
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ITGB3BPQ13352 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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