Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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