Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
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KCNMA1Q12791 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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