Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABPB1Q06547 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms