Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RELAQ04206 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RELAQ04206 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RELAQ04206 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RELAQ04206 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RELAQ04206 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RELAQ04206 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RELAQ04206 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RELAQ04206 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RELAQ04206 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RELAQ04206 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RELAQ04206 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELAQ04206 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELAQ04206 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELAQ04206 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELAQ04206 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELAQ04206 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELAQ04206 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELAQ04206 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELAQ04206 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELAQ04206 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELAQ04206 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELAQ04206 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RELAQ04206 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELAQ04206 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELAQ04206 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELAQ04206 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELAQ04206 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELAQ04206 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELAQ04206 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELAQ04206 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELAQ04206 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELAQ04206 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELAQ04206 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELAQ04206 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELAQ04206 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELAQ04206 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELAQ04206 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELAQ04206 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELAQ04206 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELAQ04206 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELAQ04206 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELAQ04206 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELAQ04206 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RELAQ04206 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RELAQ04206 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RELAQ04206 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RELAQ04206 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RELAQ04206 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RELAQ04206 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RELAQ04206 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RELAQ04206 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RELAQ04206 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RELAQ04206 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RELAQ04206 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RELAQ04206 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RELAQ04206 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RELAQ04206 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RELAQ04206 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RELAQ04206 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RELAQ04206 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RELAQ04206 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RELAQ04206 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RELAQ04206 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RELAQ04206 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RELAQ04206 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RELAQ04206 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RELAQ04206 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RELAQ04206 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RELAQ04206 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RELAQ04206 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RELAQ04206 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RELAQ04206 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RELAQ04206 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RELAQ04206 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RELAQ04206 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RELAQ04206 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RELAQ04206 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RELAQ04206 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RELAQ04206 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RELAQ04206 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RELAQ04206 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RELAQ04206 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RELAQ04206 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RELAQ04206 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RELAQ04206 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RELAQ04206 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RELAQ04206 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RELAQ04206 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RELAQ04206 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RELAQ04206 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RELAQ04206 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RELAQ04206 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RELAQ04206 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RELAQ04206 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RELAQ04206 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RELAQ04206 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RELAQ04206 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RELAQ04206 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RELAQ04206 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms