Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF6P62330 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF6P62330 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF6P62330 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF6P62330 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF6P62330 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF6P62330 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF6P62330 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF6P62330 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF6P62330 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF6P62330 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF6P62330 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF6P62330 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF6P62330 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF6P62330 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF6P62330 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF6P62330 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF6P62330 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF6P62330 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF6P62330 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF6P62330 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF6P62330 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF6P62330 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF6P62330 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF6P62330 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF6P62330 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF6P62330 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF6P62330 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF6P62330 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF6P62330 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
ARF6P62330 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF6P62330 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF6P62330 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF6P62330 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF6P62330 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF6P62330 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF6P62330 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF6P62330 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF6P62330 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF6P62330 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF6P62330 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF6P62330 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF6P62330 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF6P62330 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF6P62330 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF6P62330 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF6P62330 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF6P62330 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF6P62330 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF6P62330 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF6P62330 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF6P62330 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF6P62330 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF6P62330 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF6P62330 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF6P62330 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF6P62330 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF6P62330 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF6P62330 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF6P62330 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF6P62330 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF6P62330 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF6P62330 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF6P62330 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF6P62330 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF6P62330 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF6P62330 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF6P62330 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF6P62330 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF6P62330 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF6P62330 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF6P62330 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF6P62330 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF6P62330 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF6P62330 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF6P62330 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF6P62330 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF6P62330 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF6P62330 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF6P62330 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF6P62330 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF6P62330 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF6P62330 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF6P62330 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF6P62330 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF6P62330 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF6P62330 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF6P62330 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF6P62330 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF6P62330 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF6P62330 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF6P62330 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF6P62330 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF6P62330 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF6P62330 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF6P62330 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF6P62330 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF6P62330 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF6P62330 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF6P62330 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms