Protein–RNA interactions for Protein: P59665

DEFA1, Neutrophil defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA1P59665 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA1P59665 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA1P59665 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA1P59665 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA1P59665 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA1P59665 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA1P59665 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA1P59665 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA1P59665 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA1P59665 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA1P59665 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA1P59665 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA1P59665 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA1P59665 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms