Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP98P52948 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP98P52948 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP98P52948 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP98P52948 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP98P52948 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP98P52948 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP98P52948 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP98P52948 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP98P52948 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP98P52948 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP98P52948 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP98P52948 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP98P52948 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP98P52948 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP98P52948 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP98P52948 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP98P52948 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP98P52948 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP98P52948 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP98P52948 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP98P52948 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP98P52948 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP98P52948 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP98P52948 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP98P52948 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP98P52948 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP98P52948 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP98P52948 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP98P52948 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP98P52948 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP98P52948 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP98P52948 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP98P52948 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP98P52948 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP98P52948 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP98P52948 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP98P52948 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP98P52948 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP98P52948 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP98P52948 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP98P52948 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP98P52948 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP98P52948 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP98P52948 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP98P52948 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP98P52948 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP98P52948 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP98P52948 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP98P52948 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP98P52948 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP98P52948 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP98P52948 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP98P52948 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP98P52948 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP98P52948 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP98P52948 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP98P52948 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP98P52948 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP98P52948 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP98P52948 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUP98P52948 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUP98P52948 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUP98P52948 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP98P52948 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP98P52948 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP98P52948 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP98P52948 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP98P52948 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP98P52948 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP98P52948 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP98P52948 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP98P52948 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP98P52948 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP98P52948 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP98P52948 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP98P52948 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP98P52948 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP98P52948 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP98P52948 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP98P52948 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP98P52948 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP98P52948 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP98P52948 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP98P52948 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP98P52948 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP98P52948 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP98P52948 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP98P52948 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP98P52948 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP98P52948 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP98P52948 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP98P52948 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP98P52948 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP98P52948 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP98P52948 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP98P52948 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP98P52948 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP98P52948 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP98P52948 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms