Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPIAP49247 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPIAP49247 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPIAP49247 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPIAP49247 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPIAP49247 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPIAP49247 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPIAP49247 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPIAP49247 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPIAP49247 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPIAP49247 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPIAP49247 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPIAP49247 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPIAP49247 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPIAP49247 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPIAP49247 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPIAP49247 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPIAP49247 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPIAP49247 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPIAP49247 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPIAP49247 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPIAP49247 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPIAP49247 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPIAP49247 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPIAP49247 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPIAP49247 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPIAP49247 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPIAP49247 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPIAP49247 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPIAP49247 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPIAP49247 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPIAP49247 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPIAP49247 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPIAP49247 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPIAP49247 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPIAP49247 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPIAP49247 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPIAP49247 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPIAP49247 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPIAP49247 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPIAP49247 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPIAP49247 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPIAP49247 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPIAP49247 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPIAP49247 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPIAP49247 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPIAP49247 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPIAP49247 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPIAP49247 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPIAP49247 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPIAP49247 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPIAP49247 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPIAP49247 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPIAP49247 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPIAP49247 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPIAP49247 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPIAP49247 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPIAP49247 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPIAP49247 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPIAP49247 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPIAP49247 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPIAP49247 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPIAP49247 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPIAP49247 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPIAP49247 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPIAP49247 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPIAP49247 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPIAP49247 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPIAP49247 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPIAP49247 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPIAP49247 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPIAP49247 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPIAP49247 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPIAP49247 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPIAP49247 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPIAP49247 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPIAP49247 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPIAP49247 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPIAP49247 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPIAP49247 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPIAP49247 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPIAP49247 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPIAP49247 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPIAP49247 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPIAP49247 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPIAP49247 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPIAP49247 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPIAP49247 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPIAP49247 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPIAP49247 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPIAP49247 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPIAP49247 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPIAP49247 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPIAP49247 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPIAP49247 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPIAP49247 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPIAP49247 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPIAP49247 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPIAP49247 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPIAP49247 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms