Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms