Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms