Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJA4P35212 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJA4P35212 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJA4P35212 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GJA4P35212 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJA4P35212 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GJA4P35212 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJA4P35212 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GJA4P35212 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJA4P35212 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJA4P35212 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA4P35212 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA4P35212 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA4P35212 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA4P35212 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA4P35212 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA4P35212 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA4P35212 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA4P35212 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA4P35212 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA4P35212 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA4P35212 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA4P35212 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA4P35212 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA4P35212 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA4P35212 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA4P35212 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA4P35212 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA4P35212 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA4P35212 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA4P35212 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA4P35212 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA4P35212 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA4P35212 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA4P35212 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA4P35212 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJA4P35212 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA4P35212 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA4P35212 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA4P35212 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA4P35212 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA4P35212 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA4P35212 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA4P35212 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA4P35212 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA4P35212 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA4P35212 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA4P35212 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA4P35212 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA4P35212 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA4P35212 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA4P35212 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA4P35212 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA4P35212 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA4P35212 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA4P35212 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA4P35212 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA4P35212 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA4P35212 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA4P35212 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA4P35212 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA4P35212 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA4P35212 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA4P35212 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA4P35212 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA4P35212 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA4P35212 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA4P35212 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA4P35212 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA4P35212 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA4P35212 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA4P35212 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA4P35212 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA4P35212 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA4P35212 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA4P35212 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA4P35212 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJA4P35212 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJA4P35212 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJA4P35212 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJA4P35212 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJA4P35212 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJA4P35212 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJA4P35212 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJA4P35212 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GJA4P35212 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJA4P35212 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJA4P35212 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJA4P35212 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJA4P35212 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJA4P35212 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJA4P35212 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GJA4P35212 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GJA4P35212 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJA4P35212 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJA4P35212 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJA4P35212 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GJA4P35212 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GJA4P35212 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
GJA4P35212 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms