Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC12P31275 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.5 ms