Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXA11P31270 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXA11P31270 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXA11P31270 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXA11P31270 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXA11P31270 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXA11P31270 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA11P31270 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA11P31270 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA11P31270 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA11P31270 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA11P31270 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA11P31270 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA11P31270 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA11P31270 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA11P31270 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA11P31270 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA11P31270 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA11P31270 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms