Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms