Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLNP26678 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLNP26678 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PLNP26678 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLNP26678 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLNP26678 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLNP26678 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLNP26678 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLNP26678 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLNP26678 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLNP26678 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLNP26678 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLNP26678 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLNP26678 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLNP26678 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLNP26678 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLNP26678 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLNP26678 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLNP26678 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLNP26678 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLNP26678 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLNP26678 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLNP26678 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLNP26678 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLNP26678 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLNP26678 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLNP26678 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLNP26678 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLNP26678 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PLNP26678 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLNP26678 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PLNP26678 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLNP26678 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLNP26678 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLNP26678 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLNP26678 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLNP26678 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLNP26678 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLNP26678 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLNP26678 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLNP26678 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLNP26678 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLNP26678 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLNP26678 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLNP26678 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLNP26678 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLNP26678 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLNP26678 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLNP26678 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PLNP26678 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLNP26678 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PLNP26678 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLNP26678 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLNP26678 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PLNP26678 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PLNP26678 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLNP26678 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLNP26678 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLNP26678 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLNP26678 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLNP26678 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLNP26678 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLNP26678 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLNP26678 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLNP26678 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLNP26678 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLNP26678 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLNP26678 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLNP26678 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLNP26678 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLNP26678 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLNP26678 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLNP26678 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLNP26678 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLNP26678 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLNP26678 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLNP26678 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLNP26678 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLNP26678 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLNP26678 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLNP26678 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLNP26678 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLNP26678 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLNP26678 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLNP26678 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PLNP26678 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLNP26678 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLNP26678 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLNP26678 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLNP26678 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLNP26678 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms