Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHMLP26374 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMLP26374 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMLP26374 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMLP26374 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMLP26374 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMLP26374 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMLP26374 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMLP26374 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMLP26374 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMLP26374 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMLP26374 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMLP26374 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMLP26374 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMLP26374 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMLP26374 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMLP26374 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMLP26374 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMLP26374 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMLP26374 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMLP26374 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMLP26374 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMLP26374 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMLP26374 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMLP26374 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMLP26374 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMLP26374 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMLP26374 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMLP26374 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMLP26374 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMLP26374 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMLP26374 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMLP26374 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMLP26374 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMLP26374 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMLP26374 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMLP26374 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMLP26374 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMLP26374 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMLP26374 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMLP26374 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMLP26374 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMLP26374 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMLP26374 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMLP26374 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMLP26374 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMLP26374 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMLP26374 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMLP26374 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMLP26374 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMLP26374 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMLP26374 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMLP26374 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMLP26374 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMLP26374 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMLP26374 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMLP26374 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMLP26374 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMLP26374 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMLP26374 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMLP26374 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMLP26374 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMLP26374 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMLP26374 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMLP26374 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMLP26374 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMLP26374 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMLP26374 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMLP26374 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMLP26374 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMLP26374 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMLP26374 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMLP26374 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMLP26374 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMLP26374 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMLP26374 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMLP26374 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMLP26374 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMLP26374 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMLP26374 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMLP26374 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMLP26374 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMLP26374 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMLP26374 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMLP26374 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMLP26374 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMLP26374 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMLP26374 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMLP26374 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMLP26374 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMLP26374 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMLP26374 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMLP26374 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMLP26374 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMLP26374 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMLP26374 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMLP26374 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMLP26374 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMLP26374 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMLP26374 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms