Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCSHP23434 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCSHP23434 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCSHP23434 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCSHP23434 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GCSHP23434 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCSHP23434 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCSHP23434 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCSHP23434 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCSHP23434 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCSHP23434 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GCSHP23434 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GCSHP23434 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCSHP23434 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCSHP23434 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCSHP23434 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCSHP23434 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCSHP23434 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCSHP23434 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCSHP23434 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCSHP23434 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCSHP23434 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCSHP23434 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCSHP23434 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCSHP23434 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCSHP23434 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCSHP23434 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCSHP23434 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCSHP23434 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCSHP23434 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCSHP23434 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCSHP23434 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCSHP23434 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCSHP23434 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCSHP23434 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GCSHP23434 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCSHP23434 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCSHP23434 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCSHP23434 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCSHP23434 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCSHP23434 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCSHP23434 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCSHP23434 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCSHP23434 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCSHP23434 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCSHP23434 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCSHP23434 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCSHP23434 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCSHP23434 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCSHP23434 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCSHP23434 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCSHP23434 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GCSHP23434 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCSHP23434 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCSHP23434 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCSHP23434 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCSHP23434 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCSHP23434 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCSHP23434 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCSHP23434 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCSHP23434 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCSHP23434 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCSHP23434 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCSHP23434 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCSHP23434 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCSHP23434 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCSHP23434 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCSHP23434 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCSHP23434 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCSHP23434 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCSHP23434 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCSHP23434 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCSHP23434 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCSHP23434 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCSHP23434 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCSHP23434 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCSHP23434 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCSHP23434 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCSHP23434 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCSHP23434 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCSHP23434 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
GCSHP23434 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCSHP23434 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCSHP23434 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCSHP23434 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCSHP23434 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCSHP23434 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCSHP23434 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCSHP23434 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCSHP23434 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCSHP23434 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
GCSHP23434 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCSHP23434 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCSHP23434 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCSHP23434 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCSHP23434 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCSHP23434 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GCSHP23434 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GCSHP23434 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GCSHP23434 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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