Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms