Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMD1P17707 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMD1P17707 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMD1P17707 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMD1P17707 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMD1P17707 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMD1P17707 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMD1P17707 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMD1P17707 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMD1P17707 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMD1P17707 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMD1P17707 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMD1P17707 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMD1P17707 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
AMD1P17707 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMD1P17707 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMD1P17707 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMD1P17707 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMD1P17707 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMD1P17707 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMD1P17707 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMD1P17707 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMD1P17707 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMD1P17707 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMD1P17707 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMD1P17707 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMD1P17707 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMD1P17707 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMD1P17707 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMD1P17707 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
AMD1P17707 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMD1P17707 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMD1P17707 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMD1P17707 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMD1P17707 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMD1P17707 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMD1P17707 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMD1P17707 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMD1P17707 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMD1P17707 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMD1P17707 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
AMD1P17707 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMD1P17707 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMD1P17707 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMD1P17707 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMD1P17707 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMD1P17707 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMD1P17707 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMD1P17707 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMD1P17707 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMD1P17707 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMD1P17707 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
AMD1P17707 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMD1P17707 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMD1P17707 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMD1P17707 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
AMD1P17707 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMD1P17707 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMD1P17707 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMD1P17707 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMD1P17707 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMD1P17707 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMD1P17707 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMD1P17707 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMD1P17707 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMD1P17707 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMD1P17707 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMD1P17707 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMD1P17707 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMD1P17707 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMD1P17707 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMD1P17707 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMD1P17707 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMD1P17707 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMD1P17707 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMD1P17707 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMD1P17707 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMD1P17707 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMD1P17707 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMD1P17707 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMD1P17707 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMD1P17707 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMD1P17707 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
AMD1P17707 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMD1P17707 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMD1P17707 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
AMD1P17707 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AMD1P17707 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
AMD1P17707 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AMD1P17707 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AMD1P17707 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AMD1P17707 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AMD1P17707 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
AMD1P17707 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMD1P17707 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMD1P17707 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMD1P17707 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMD1P17707 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMD1P17707 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMD1P17707 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms