Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms