Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ODC1P11926 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ODC1P11926 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ODC1P11926 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ODC1P11926 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODC1P11926 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODC1P11926 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODC1P11926 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODC1P11926 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODC1P11926 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODC1P11926 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODC1P11926 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODC1P11926 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODC1P11926 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODC1P11926 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODC1P11926 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODC1P11926 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODC1P11926 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODC1P11926 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODC1P11926 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODC1P11926 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ODC1P11926 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ODC1P11926 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODC1P11926 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODC1P11926 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODC1P11926 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODC1P11926 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODC1P11926 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODC1P11926 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODC1P11926 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODC1P11926 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODC1P11926 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODC1P11926 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODC1P11926 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODC1P11926 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODC1P11926 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODC1P11926 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODC1P11926 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODC1P11926 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODC1P11926 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODC1P11926 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODC1P11926 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODC1P11926 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODC1P11926 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODC1P11926 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODC1P11926 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODC1P11926 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODC1P11926 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODC1P11926 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODC1P11926 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODC1P11926 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODC1P11926 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODC1P11926 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODC1P11926 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ODC1P11926 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ODC1P11926 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ODC1P11926 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ODC1P11926 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ODC1P11926 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ODC1P11926 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ODC1P11926 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ODC1P11926 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ODC1P11926 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ODC1P11926 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ODC1P11926 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ODC1P11926 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ODC1P11926 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ODC1P11926 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ODC1P11926 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ODC1P11926 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ODC1P11926 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ODC1P11926 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ODC1P11926 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ODC1P11926 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ODC1P11926 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ODC1P11926 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ODC1P11926 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ODC1P11926 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ODC1P11926 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ODC1P11926 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ODC1P11926 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ODC1P11926 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ODC1P11926 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ODC1P11926 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ODC1P11926 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ODC1P11926 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ODC1P11926 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ODC1P11926 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ODC1P11926 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ODC1P11926 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ODC1P11926 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ODC1P11926 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ODC1P11926 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ODC1P11926 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ODC1P11926 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ODC1P11926 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ODC1P11926 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ODC1P11926 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ODC1P11926 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ODC1P11926 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms