Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSIG8P0DPA2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms