Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf89P0DMQ9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
C8orf89P0DMQ9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
C8orf89P0DMQ9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
C8orf89P0DMQ9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
C8orf89P0DMQ9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
C8orf89P0DMQ9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
C8orf89P0DMQ9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
C8orf89P0DMQ9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf89P0DMQ9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf89P0DMQ9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf89P0DMQ9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf89P0DMQ9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf89P0DMQ9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf89P0DMQ9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf89P0DMQ9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf89P0DMQ9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf89P0DMQ9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf89P0DMQ9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf89P0DMQ9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf89P0DMQ9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf89P0DMQ9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf89P0DMQ9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf89P0DMQ9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf89P0DMQ9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf89P0DMQ9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf89P0DMQ9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf89P0DMQ9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf89P0DMQ9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf89P0DMQ9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf89P0DMQ9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf89P0DMQ9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf89P0DMQ9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C8orf89P0DMQ9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C8orf89P0DMQ9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms