Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms