Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA5P08648 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGA5P08648 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGA5P08648 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms