Protein–RNA interactions for Protein: P04259

KRT6B, Keratin, type II cytoskeletal 6B, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6BP04259 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT6BP04259 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms