Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOA1P02647 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOA1P02647 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOA1P02647 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOA1P02647 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOA1P02647 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOA1P02647 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOA1P02647 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOA1P02647 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOA1P02647 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOA1P02647 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOA1P02647 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOA1P02647 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOA1P02647 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOA1P02647 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOA1P02647 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOA1P02647 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
APOA1P02647 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOA1P02647 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOA1P02647 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOA1P02647 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOA1P02647 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOA1P02647 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOA1P02647 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOA1P02647 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOA1P02647 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOA1P02647 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOA1P02647 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOA1P02647 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOA1P02647 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOA1P02647 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOA1P02647 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOA1P02647 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOA1P02647 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOA1P02647 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOA1P02647 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOA1P02647 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOA1P02647 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOA1P02647 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOA1P02647 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOA1P02647 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOA1P02647 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOA1P02647 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOA1P02647 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOA1P02647 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOA1P02647 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOA1P02647 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOA1P02647 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOA1P02647 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOA1P02647 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
APOA1P02647 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOA1P02647 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
APOA1P02647 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOA1P02647 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOA1P02647 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
APOA1P02647 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOA1P02647 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOA1P02647 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOA1P02647 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOA1P02647 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOA1P02647 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOA1P02647 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOA1P02647 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOA1P02647 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOA1P02647 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA1P02647 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA1P02647 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA1P02647 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA1P02647 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA1P02647 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA1P02647 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA1P02647 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA1P02647 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA1P02647 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA1P02647 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA1P02647 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA1P02647 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA1P02647 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA1P02647 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA1P02647 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA1P02647 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA1P02647 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA1P02647 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA1P02647 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA1P02647 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA1P02647 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA1P02647 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA1P02647 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA1P02647 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA1P02647 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA1P02647 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA1P02647 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA1P02647 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA1P02647 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA1P02647 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA1P02647 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA1P02647 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA1P02647 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA1P02647 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOA1P02647 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms