Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF1O43189 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF1O43189 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF1O43189 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF1O43189 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF1O43189 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF1O43189 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF1O43189 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF1O43189 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF1O43189 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF1O43189 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF1O43189 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF1O43189 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF1O43189 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF1O43189 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF1O43189 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF1O43189 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF1O43189 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF1O43189 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF1O43189 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF1O43189 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF1O43189 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF1O43189 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF1O43189 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF1O43189 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF1O43189 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF1O43189 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF1O43189 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF1O43189 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF1O43189 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF1O43189 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF1O43189 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF1O43189 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF1O43189 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF1O43189 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF1O43189 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF1O43189 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF1O43189 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF1O43189 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF1O43189 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF1O43189 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF1O43189 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF1O43189 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF1O43189 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF1O43189 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF1O43189 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHF1O43189 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHF1O43189 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHF1O43189 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHF1O43189 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHF1O43189 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHF1O43189 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF1O43189 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF1O43189 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF1O43189 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF1O43189 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF1O43189 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF1O43189 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF1O43189 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF1O43189 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF1O43189 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF1O43189 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF1O43189 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF1O43189 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF1O43189 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF1O43189 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF1O43189 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF1O43189 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF1O43189 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF1O43189 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF1O43189 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF1O43189 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF1O43189 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF1O43189 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF1O43189 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF1O43189 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF1O43189 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF1O43189 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF1O43189 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF1O43189 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF1O43189 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF1O43189 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF1O43189 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF1O43189 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF1O43189 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF1O43189 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF1O43189 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF1O43189 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF1O43189 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF1O43189 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF1O43189 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF1O43189 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF1O43189 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF1O43189 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF1O43189 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF1O43189 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF1O43189 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF1O43189 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF1O43189 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF1O43189 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms