Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms