Protein–RNA interactions for Protein: A6NDZ8

MBD3L4, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L4A6NDZ8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD3L4A6NDZ8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD3L4A6NDZ8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD3L4A6NDZ8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD3L4A6NDZ8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD3L4A6NDZ8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD3L4A6NDZ8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD3L4A6NDZ8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD3L4A6NDZ8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD3L4A6NDZ8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD3L4A6NDZ8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD3L4A6NDZ8 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD3L4A6NDZ8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD3L4A6NDZ8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD3L4A6NDZ8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD3L4A6NDZ8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD3L4A6NDZ8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD3L4A6NDZ8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD3L4A6NDZ8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD3L4A6NDZ8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD3L4A6NDZ8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD3L4A6NDZ8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD3L4A6NDZ8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD3L4A6NDZ8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD3L4A6NDZ8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD3L4A6NDZ8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD3L4A6NDZ8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD3L4A6NDZ8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD3L4A6NDZ8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD3L4A6NDZ8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD3L4A6NDZ8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD3L4A6NDZ8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD3L4A6NDZ8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD3L4A6NDZ8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD3L4A6NDZ8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD3L4A6NDZ8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD3L4A6NDZ8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MBD3L4A6NDZ8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MBD3L4A6NDZ8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MBD3L4A6NDZ8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms