Protein–RNA interactions for Protein: A4D161

FAM221A, Protein FAM221A, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM221AA4D161 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM221AA4D161 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM221AA4D161 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms