Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf170A2RU37 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms