Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms