Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6N4

TRBV25-1, T-cell receptor beta variable 25-1 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV25-1A0A075B6N4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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TRBV25-1A0A075B6N4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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TRBV25-1A0A075B6N4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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TRBV25-1A0A075B6N4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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TRBV25-1A0A075B6N4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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TRBV25-1A0A075B6N4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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