Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MAP3K4Q9Y6R4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms